بررسی بیان ژنهای گیرنده نوری و ژنهای هدف مسیر پاسخ به تابش UV-B در جلبک Volvox carteri

Authors

  • حسنپور, کریم دانشگاه تبریز، دانشکده کشاورزی، گروه ژنتیک و اصلاح نژاد دام
  • رازقی, جعفر گروه زیست شناسی گیاهی، دانشکده علوم طبیعی، دانشگاه تبریز، ایران
  • موافقی, علی دانشگاه تبریز، دانشکده علوم طبیعی، گروه زیست شناسی گیاهی
Abstract:

نور مهمترین منبع انرژی برای موجودات فتوسنتزی است. پروتئین­های گیرنده نور قادرند تا طول موج­های خاصی از نور را دریافت کرده و مسیر انتقال سیگنال را آغاز نمایند. Volvox carteri جلبک سبز پرسلولی ساده با داشتن ویژگی­های منحصر­به ­فرد خود، به­عنوان مدل یوکاریوتی کمتر تکامل یافته برای مطالعه تکامل و توسعه گیرنده­ های نوری بسیار مناسب است. در پژوهش حاضر، اثر تابش (UV-B (0.056 mw.cm-2 بر بیان 13 ژن گیرنده نوری با استفاده از داده ­های RNA-Seq مورد بررسی قرار­گرفت. این گیرنده­ها برای نظارت بر نور و سازگاری فعالیت­های فیزیولوژیکی جلبک با تغییرات محیطی مورد نیاز هستند. بر اساس نتایج بدست آمده، در شدت پایین اشعه ماوراء بنفش، بیان ژن­های گیرنده­ نوری در سلول­های جنسی و غیرجنسی، در مقایسه با گروه­های کنترل، معنی­دار نشد. با این حال، مقایسه بیان این ژن­ها در این دو نوع سلول نشان داد که گیرنده­های نوری Phot، CRYp، ChR1-2، HKR1-4 و (VOP (VR1 الگوی بیان ویژه نوع سلول را نمایش می­دهند. در حالی­که بیان گیرنده­ های نوری UVR8، CRYd1-2 و CRYa در هر دو نوع سلول مشابه بود. به نظر می­رسد که به ­علت تجمع غالب رونوشت ژن­های هدف مسیر پاسخگو به UV-B در سلول­های غیرجنسی، احتمال دارد که UV-B به­طور غیر­مستقیم رونویسی ژن را در این موجود تحت تاثیر قرار­داده­باشد. الگوی پروفایل ترنسکریپتوم میان این دو نوع سلول که هم در مورد گیرنده ­های نوری و هم در بررسی ژن­های هدف مسیر پاسخگو به UV-B مشاهده شد؛ ماهیت متفاوت و تمایزیابی سلولی را در این جلبک نشان داد.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

بررسی الگوی بیان ژن ویژه تیپ سلولی در جلبک Volvox carteri تحت شرایط تنش نوری

طول موج‌های UV-B عمیق‌تر از هر طول موج دیگری به آب نفوذ می‌کنند. موجودات یوکاریوتی پیچیده از طریق بیان انتخابی بخش ویژه‌ای از ژنوم یکسان در انواع مختلف سلول، در پاسخ به نشانه‌های نموی و محیطی از قبیلUV-B تکامل یافته‌اند. تشکیل موجودات پرسلولی به مسیر‌های سیگنالینگ ژنتیکی از پیش تعریف شده در انواع مختلف سلول نیاز دارد. انواع مختلف سلول باید بتوانند پاسخ‌های سازشی مناسب را نسبت به محیط در حال تغی...

full text

همسانه‌سازی و بررسی فیلوژنتیکی توالی‌های دو ژن ‌ متعلق به زیر خانواده کریپتوکروم DASH جلبک Volvox carteri

در اکثر موجودات، گیرنده های نوری پیام رسانی به منظور درک و تفسیر علائم محیطی به‌وجود آمده‌اند. این مولکول‌ها قادرند، نور را توسط کروموفورهای خود جذب کرده، مسیرهای پیام رسانی خاصی را در سلو‌ل‌ها به راه انداخته و سبب بروز پاسخ مناسب در سلول شوند. شاخه جدیدی از علم به‌ نام اپتوژنتیک تلاش می‌کند تا از گیرنده های نوری به عنوان ابزارهای مولکولی جهت کنترل دقیق وقایع سلولی استفاده کند. یکی از راه‌های ت...

full text

Sexual Induction in Volvox Carteri

The study of the dependence of reactions on the concentration of various compounds is often of great value in determining reaction mechanisms . In chemical kinetics, it is often found that, according to van't Hoff's rule, the order of dependence of a reaction on the concentration of some compound involved in that reaction is equal to the number of molecules of the compound involved in each reac...

full text

افزایش بیان ژنهای سوکسینات دهیدروژناز و پروفوبیلینوژن دی آمیناز در پاسخ به تنش شوری درگندم ماهوتی

به منظور شناسایی مکانیسم های درگیر در تحمل به شوری ، ژنهای پاسخ دهنده به تنش شوری از گندم ماهوتی که از متحمل ترین ارقام بومی کشور به تنش شوری می باشد توسط روش نمایش افتراقی جداسازی گردید. دو ژن که تعداد نسخه های آنها در اثر شوری افزایش می یابد wsr1 و wsr2 نامیده شدند. wsr1 شباهت بسیار زیادی به آنزیمی بنام سوکسینات دهیدروژناز داشت. افزایش رونوشت این ژن در اثر شوری احتمالا" مربوط به واکنشی است ک...

full text

Two Different Rickettsial Bacteria Invading Volvox carteri

BACKGROUND Bacteria of the family Rickettsiaceae are principally associated with arthropods. Recently, endosymbionts of the Rickettsiaceae have been found in non-phagotrophic cells of the volvocalean green algae Carteria cerasiformis, Pleodorina japonica, and Volvox carteri. Such endosymbionts were present in only C. cerasiformis strain NIES-425 and V. carteri strain UTEX 2180, of various strai...

full text

A Preliminary Genetic Investigation of VOLVOX CARTERI.

A preliminary genetic analysis of a number of genetic variants of Volvox carteri f. nagariensis is presented. Techniques are outlined for mutagenesis of Volvox, isolation of mutants and routine genetic analysis. All of the mutants show simple Mendelian segregation patterns and have been tentatively placed in 14 linkage groups.

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


Journal title

volume 7  issue 2

pages  125- 137

publication date 2019-01

By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.

Keywords

No Keywords

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023